1株广谱抗真菌芽孢杆菌TR21的鉴定

• 作者: 周林 喻国辉 沈汉国 牛春燕 程萍 陈燕红
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 枯草芽孢杆菌 鉴定 API鉴定系统 16S rDNA gyrA基因 gyrB基因
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 605-609
• 分类号: Q939
• 字数: 3392字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.04.018

摘要

利用API 50 CH鉴定系统、16S rDNA、gyrA和gyrB基因序列分析法,对1株分离自石斛兰叶片的广谱抗真菌芽孢杆菌TR21进行生化和分子鉴定.通过API 50 CH系统测试,TR21菌株与枯草芽孢杆菌相似性为90.3%,被鉴定为枯草芽孢杆菌.利用16S rDNA序列分析发现TR21菌株与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、B.subtilis subsp.subtilis、B.subtilis subsp.spizizenii和B.velezensis的相应核苷酸序列具有很高的同源性,其序列相似性皆为99%,而基于gyrA和gyrB基因序列构建的系统发育树显示,该菌株与枯草芽孢杆菌的相似性分别为96%和91%.结合16S rDNA、gyrA和gyrB基因序列分析,也确定该菌为枯草芽孢杆菌.比较API鉴定和基于不同基因的鉴定发现,分子鉴定更加快速、灵敏.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程萍	华中农业大学生命科学技术学院	40	571	14.0	22.0
4	陈燕红		20	361	11.0	18.0
8	沈汉国		11	43	4.0	6.0
9	周林	华中农业大学生命科学技术学院	8	150	6.0	8.0
16	牛春燕		1	17	1.0	1.0