中国荷斯坦牛CXCR1基因遗传多态性与体细胞评分的关联分析

• 作者: 吴海涛 周里根 尹召华 常玲玲 施雪奎 杨章平 梁祥焕 毛永江 王建勇 陈仁金 陈莹
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 中国荷斯坦牛 CXCR1基因 PCR-SSCP 多态性 单倍型 体细胞评分
• 年，卷（期）: 2010,（18）
• 页码范围: 3848-3856
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.18.020

摘要

[目的]研究中国荷斯坦奶牛CXCR1基因的多态性及其与体细胞评分(Somatic cell score,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程.[方法]采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛CXCR1基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对CRCR1基因的多态位点与SCS进行相关分析,利用PHASE软件对4个多态位点进行单倍型分析.[结果]检测到4个SNPs,在5侧翼区发现了3个SNPs(-1830(A/G)、-1768(T/A),-344(T/C)),在编码区783(C/A)位点为新发现的SNP.-1830(A/G)位点从基因型个体SCS极显著低于AG基因型个体(P<0.01),-1768(T/A)位点TT基因型个体SCS极显著低于TA基因型个体(P<0.01),-344(T/C)位点TT基因型个体SCS极显著低于TC、CC个体(P<0.01).783(C/A)位点基因型个体的SCS差异不显著.单倍型Haplo2(ATTA)纯合基因型的SCS极显著低于Haplo1(ATCA)、Haplo3(GACA)和Haplo4(GATA)单倍型纯合基因型(P<0.01).[结论]-1830(A/G)位点AA基因型、-1768(T/A)位点TT基因型和-344(T/C)位点TT基因型以及单倍型Haplo2(ATTA)纯合体对中国荷斯坦牛的SCS具有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选.