中国荷斯坦牛CXCR1基因SNPs与白血病易感性的关联分析

• 作者: 倪炜 张慧敏 李明勋 杨奕 杨章平 毛永江 王成明 王梦琦 邢世宇
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荷斯坦牛 牛白血病 CXCR1基因 关联分析 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1637-1642
• 页数: 6页
• 分类号: S823
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.10.009

摘要

牛白血病是由牛白血病病毒(Bovine leukemia virus,BLV)引起的牛(Bos taurus)、绵羊(Ovis aries)等动物的慢性肿瘤性疾病,是影响养牛业发展的重要传染病之一.为探索牛趋化因子受体l (chemokine (C-X-C motif) receptor 1,CXCR1)基因编码区(coding sequence,CDS)SNPs与牛白血病易感性之间的关系,本研究用荧光共振能量转移-定量多聚酶链式反应(fluorescence resonance energy transfer-quantitative polymerase chain reaction,FRET-qPCR)对某大型奶牛场866头中国荷斯坦牛牛白血病感染情况进行检测,同时用飞行时间质谱法(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)对CXCR1基因编码区CXCR1-c.642 A＞G、CXCR1-c.816C＞A、CXCR1-c.980A＞G和CXCR1-c.1068G＞A4个SNPs位点进行检测,采用Logistic回归分析CXCR1 SNPs基因型与牛白血病易感性之间的关系,结果表明:在866头奶牛中,患白血病的牛为42头,阳性率为4.85％;CXCR1-c.642 A＞G、CX CR1-c.816C＞A、CXCR1-c.980A＞G和CXCR1-c.1068G＞A4个SNPs位点优势基因型分别为GG、CC、AA和GG型,频率分别为0.580、0.466、0.60和0.658.CXCR1-c.980 A＞G位点对牛患白血病的相对风险影响达到显著水平(P=0.016).CXCR1-c.980 A＞G位点GG型基因患白血病的概率为AA型基因的5.04倍.而CXCR1-c.642 A＞G、CXCR1-c.816C＞A、CXCR1-c.1068G＞A和CXCR1单倍型对牛白血病易感性无显著影响(P＞0.05).CXCR1c.980A＞G位点可作为奶牛白血病抗病育种的分子标记之一,筛选CXCR1-c.980A＞G位点AA型个体有助于降低奶牛对牛白血病的易感性并提高生产效率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨章平	扬州大学动物科学与技术学院	200	1464	19.0	27.0
2	杨奕	扬州大学兽医学院	3	3	1.0	1.0
3	邢世宇	扬州大学动物科学与技术学院	16	37	3.0	5.0
4	王梦琦	扬州大学动物科学与技术学院	17	31	3.0	4.0
5	张慧敏	扬州大学动物科学与技术学院	29	50	4.0	5.0
6	李明勋	扬州大学动物科学与技术学院	16	9	2.0	2.0
7	倪炜	扬州大学动物科学与技术学院	11	18	3.0	4.0
8	王成明	扬州大学兽医学院	5	8	1.0	2.0