牛SLC27A1基因SNPs筛选及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的关联分析

• 作者: 刘开东 吕延飞 孙丹 张世芳 张莉 杜立新 柳楠 路国彬 陆健 魏彩虹
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: SLC27A1基因 SNPs PCR-SSCP PCR-RFLP 产奶性状
• 年，卷（期）: 2010,（23）
• 页码范围: 12471-12475
• 分类号: S858.23
• 字数: 4664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2010.23.063

摘要

[目的]对牛SLC27A1基因进行SNPs筛选并与中国荷斯坦奶牛的产奶性状进行关联分析,以期发现对中国荷斯坦奶牛产奶性状有显著影响的SNP位点.[方法]根据性能测定记录选取48头中国荷斯坦奶牛,提取血样DNA,组成2个DNA池,用于SNPs筛选,采用PCR-SSCP和克隆测序方法对DNA池进行SLC27A1基因SNPs筛选.针对发现的SNP位点,采用PCR-RFLP方法对另外231头中国荷斯坦奶牛进行群体基因型检测,采用SAS(8.02)GLM过程对各基因型与产奶性状进行关联分析.[结果]在exon3发现T112C位点,在3‘UTR 发现G64A位点,T112C为同义突变;经PCR-RFLP检测,发现在T112C位点存在TT、TC、CC 3种基因型,G64A位点存在GG、GA、AA 3种基因型.2个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态.T112C位点的CC型个体的产奶量极显著高于TC型个体(P<0.01),3种基因型对乳蛋白率和乳脂率影响均不显著(P>0.05),乳蛋白率呈现CC>TC>TT的趋势,乳脂率呈现TT>TC>CC的趋势;G64A位点3种基因型对产奶量、乳蛋白率、乳脂率的影响均不显著(P>0.05),但产奶量呈现GA>GG>AA的趋势,乳蛋白率和乳脂率呈现AA>GG>GA的趋势.[结论]该基因T112C位点与产奶量性状有一定的关联性,通过提高CC基因型频率有望提高中国荷斯坦奶牛的产奶量,SLC27A1基因可作为调控中国荷斯坦奶牛产奶量的候选基因,同时为该基因的标记辅助育种和进一步研究奠定了良好基础.