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摘要:
通过统合分析整合多个独立实验QTL(quantlitative trait locus)定位结果获得的一致性OTL,可为标记辅助育种和基因图位克隆提供坚实基础.但是这种方法没有充足的生物学背景支撑,而且遗传图谱间不同映射会严重影响分析结果.为此,本文提出一种基于连锁图的QTL综合分析法,简称关联图分析.首先,利用连锁群构建图模型;然后,利用非监督分类法来寻找基因组间具有模式性共分离趋势的标记区间;最后,通过频繁集挖掘法对这些标记区间挖掘以获得与QTL紧密连锁的分子标记(区间).新方法通过Monte Carlo模拟研究和3个棉花QTL定位结果的综合分析予以证实.新方法的优点在于:不需要构建参考图谱;利用基因组间的分子标记模式性共分离趋势来查找特异性QTL,在一定程度上排除了初始QTL的干扰;通过非特异性QTL获得的具有潜在育种价值的分子标记,在作物育种上更有利用价值.
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文献信息
篇名 关联图分析:一种基于连锁图的QTL综合分析方法
来源期刊 科学通报 学科
关键词 连锁图 数量性状基因座 统合分析 关联图分析
年,卷(期) 2010,(29) 所属期刊栏目 论文
研究方向 页码范围 2828-2836
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.1007/s11434-010-4185-1
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作者信息
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1 章元明 32 1651 18.0 32.0
2 匡峰磊 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
连锁图
数量性状基因座
统合分析
关联图分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
科学通报
旬刊
0023-074X
11-1784/N
大16开
北京东城区东黄城根北街16号
80-213
1950
chi
出版文献量(篇)
11887
总下载数(次)
74
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
江苏省自然科学基金
英文译名:Natural Science Foundation of Jiangsu Province
官方网址:http://www.jsnsf.gov.cn/News.aspx?a=37
项目类型:
学科类型:
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