重建代谢网络及其结构与功能的分析

• 作者: 丁彦蕊 丁德武 陆克中 须文波 黄海生
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 工学
• 关键词: 代谢网络 度分布 蝴蝶结 小世界
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 591-596
• 分类号: TP339|Q5
• 字数: 6971字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2010.05.007

摘要

文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能.首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库.然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作.用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线.最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体.该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络.同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆克中	池州学院数学与计算机科学系	37	123	7.0	9.0
2	黄海生	池州学院数学与计算机科学系	24	192	5.0	13.0
3	须文波	江南大学信息工程学院	409	3078	23.0	34.0
4	丁彦蕊	江南大学信息工程学院	51	266	9.0	14.0
5	丁德武	池州学院数学与计算机科学系	37	85	5.0	7.0