利用Mascot程序与家蚕EST数据对质谱数据进行鉴定

• 作者: 刘晓勇 刘海军 姚勤 陈克平
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕 中肠 质谱 表达序列标签 肽指纹图谱
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 2561-2569
• 分类号: S8
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究和检验利用Mascot程序与家蚕EST数据解析质谱分析的结果,鉴定目标蛋白的方法.[方法]将家蚕5龄起蚕中肠总蛋白进行二维电泳分离,并运用质谱对80个蛋白点进行肽指纹图谱分析,利用Mascot程序和经自主编制软件Transeq翻译的EST序列数据库对所得质谱数据进行鉴定.[结果]鉴定出其中41个蛋白,并利用EST电子克隆在其余39个蛋白中得到19个蛋白的全长或较长cDNA.[结论]本文提出的利用家蚕EST数据来解析家蚕蛋白质谱结果的方法,能够鉴定仅利用公共数据不能鉴定的蛋白,并能鉴别基因可变剪接后产生蛋白异形体的问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈克平	江苏大学生命科学研究院	102	716	13.0	21.0
2	姚勤	江苏大学生命科学研究院	70	604	13.0	21.0
3	刘海军	江苏大学生命科学研究院	6	21	4.0	4.0
4	刘晓勇	江苏大学生命科学研究院	14	174	7.0	13.0