藏族外周血淋巴细胞表达序列标签分析

• 作者: 于军 徐树青 格日力 童晓梅 郑晓光 陈云天
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 生物学
• 关键词: 藏族 淋巴细胞 表达序列标签 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2010,（44）
• 页码范围: 50-52
• 分类号: Q987
• 字数: 2042字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2010.44.025

摘要

目的 对藏族外周血淋巴细胞cDNA文库进行随机大规模表达序列标签(ESTs)测序并进行生物信息学分析,通过序列比对找到与低氧适应相关基因有关的单核苷酸多态性(SNPs)位点.方法 将部分文库经大肠杆菌BM 25.8质粒化,用5′端测序引物进行测序,利用BLAST程序对获得的ESTs从核苷酸和氨基酸水平进行同源性搜索和比对.结果 经序列比对发现突变位点较多发生在UTR区域,同时一些基因的编码区域也发生蛋白序列的变化.对这些基因注释后发现,有些突变发生在与能量代谢、线粒体相关的基因及一氧化氮合酶上,如GTPase、NDUFA6、ATP5L、NOSIP.结论 ESTs技术是一个快速、有效寻找新基因的方法,是系统研究不同人群基因表达模式的有力工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	格日力	青海大学高原医学研究中心	152	912	15.0	20.0
2	于军	中国科学院北京基因组研究所	40	229	8.0	14.0
3	徐树青	中国科学院北京基因组研究所	3	8	1.0	2.0
4	陈云天		4	13	1.0	3.0
5	童晓梅	中国科学院北京基因组研究所	2	0	0.0	0.0
6	郑晓光	中国科学院北京基因组研究所	2	0	0.0	0.0