中国HIV-1 vpr基因多态性及其进化树的分析

• 作者: 何艳 刘猛 周华英 张春迎 谌资 郑力文 郑煜煌 陈霞
• 来源期刊: 中国医师杂志
• 学科: 医学
• 关键词: vpr基因产物 人免疫缺陷病毒/遗传学 HIV感染/遗传学 多态现象 遗传
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 307-310
• 分类号: R3
• 字数: 3262字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2010.03.007

摘要

目的 分析中国各地HIV-1感染者的vpr基因多态性,比较HIV-1 vpr基因变异的基本特征及其与国外以往研究的异同,为进一步探索HIV-1 vpr的致病机理及可能的基因治疗靶位打下基础.方法 提取348例中国各地区HIV-1感染者血浆病毒RNA,运用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HIV-1 vpr基因,凝胶电泳鉴定后行基因测序.用Blast、Clustal W、Mega4.0等相关生物分析软件进行vPr基因核苷酸和vpr氨基酸序列分析,并构建进化树,分析中国HIV-1感染者的vpr基因的多态性、变异特征和亚型的分子流行病学特征.结果 按vpr基因分型共发现AB、AE、BC、B、C 5种HIV-1亚型,分别占2.60%,55.19%,2.60%,18.18%,21.43%,其中AE亚型比例最大.观察到vpr氨基酸序列有9个变异率大于20%的位点.结论 首次分析中国感染者的HIV-1vpr基因多态性及其基因进化树的特征,发现一些vpr变异率较大的氨基酸位点,这些Vpr氨基酸序列的变异与其致病能力的关系有待进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周华英	中南大学湘雅二医院传染科	23	134	7.0	11.0
2	何艳	中南大学湘雅二医院传染科	58	248	10.0	13.0
3	郑煜煌	中南大学湘雅二医院传染科	67	345	11.0	15.0
4	刘猛	中南大学湘雅二医院传染科	12	51	4.0	7.0
5	谌资	中南大学湘雅二医院传染科	12	44	4.0	6.0
6	张春迎	中南大学湘雅二医院传染科	5	1	1.0	1.0
7	郑力文	中南大学湘雅二医院传染科	7	17	3.0	4.0
8	陈霞	中南大学湘雅二医院传染科	18	63	5.0	7.0