大豆质膜内在水孔蛋白的生物学功能预测

• 作者: 华宿南 潘陈陈 王晓波 解天然
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 大豆 生物信息学 大豆质膜内在水孔蛋白
• 年，卷（期）: 2010,（34）
• 页码范围: 封2,封3
• 分类号: Q71
• 字数: 1676字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2010.34.238

摘要

[目的]利用生物信息学方法对大豆质膜内在水孔蛋白(GmPIP)的亚细胞定位、跨膜区、信号肽和磷酸化位点进行预测,为基因的功能研究提供参考.[方法]从干旱胁迫后的抗旱大豆品种晋豆21的叶片中克隆出GmPIP基因,利用PSLpred、Protcomp Version8.0、WoLF PSORT、CELLO v2.5等亚细胞预测工具进行亚细胞定位预测;利用TMHMM Server v. 2.0进行蛋白跨膜区分析;利用NetPhos2.0 Server进行磷酸化位点分析;利用SignalP 3.0 Server程序进行信号肽分析.[结果]综合4种工具的预测结果表明,GmPIP蛋白包含6个跨膜区,亚细胞定位预测表明该蛋白位于细胞质膜上,发现该蛋白的第254个氨基酸是一个潜在的糖基化位点和13个磷酸化位点,该蛋白没有明显的信号肽结构.[结论]利用不同方法进行的生物信息学分析结果可相互验证,生物信息学可以对未知蛋白进行初步的功能预测,有助于确定后续试验的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晓波	安徽农业大学农学院	16	156	8.0	12.0
2	解天然	安徽农业大学农学院	1	9	1.0	1.0
3	潘陈陈	安徽农业大学农学院	1	9	1.0	1.0
4	华宿南	安徽农业大学农学院	1	9	1.0	1.0