一种用于定量分析ABO基因启动子区域甲基化水平方法的建立

• 作者: 严力行 吕杭军 和艳敏 应燕玲 朱发明 许先国 陶苏丹
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 重亚硫酸盐直接测序法 甲基化 CpG岛 定量
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 4-6
• 页数: 3页
• 分类号: Q344+.13
• 语种: 中文

摘要

目的:建立重亚硫酸盐测序法(BSP法)定量分析ABO基因启动子区CpG岛的甲基化水平.方法:提取胃癌细胞株MKN45和KatoⅢ以及人全血基因组DNA,以重亚硫酸盐转化法修饰其DNA,应用Meth Primer软件在ABO基因启动子区非CpG位点区设计4对特异性甲基化扩增引物,将ABO启动子附近区域的CpG岛分成4个片段分别扩增,优化PCR扩增条件后进行T-A载体克降和测序分析,采用BiQ Analyzer软件分析ABO基因启动子区CpG岛的甲基化水平.结果:PCR扩增获得了约2kb的完整CpG岛片段,共包含191个CpG位点,测序图谱证实亚硫酸盐转化修饰完全.MKN28细胞株整个CpG岛内191个检测的CpG位点全部甲基化,细胞株KatoⅢ甲基化比例为8.9%,随机标本DNA甲基化比例为30.4%.结论:建立的方法可检测出ABO基因启动子区CpG岛所有CpG位点的甲基化状况,定量分析其甲基化水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	和艳敏		13	41	3.0	6.0
2	陶苏丹		7	21	2.0	4.0
3	应燕玲		8	34	3.0	5.0
4	朱发明		108	522	13.0	18.0
5	吕杭军		69	342	11.0	14.0
6	严力行		91	548	14.0	18.0
7	许先国		52	370	13.0	17.0