日本血吸虫被膜蛋白Sj-TSP2基因序列多态性分析

• 作者: 张丽丽 徐新东 潘卫庆
• 来源期刊: 国际医学寄生虫病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 日本血吸虫 Sj-TSP2 等位基因 多态性
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 257-260
• 分类号: R383.24
• 字数: 3192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4122.2011.05.001

摘要

目的 分析日本血吸虫Sj-TSP2序列多态性.方法 抽提单条日本血吸虫成虫的总RNA,逆转录合成cDNA,PCR扩增目的片段.将目的片段克隆到载体pBlue2KSM中转化大肠杆菌,挑取10个阳性克隆测序.将获得的Sj-TSP2序列导入DnaSP序列分析软件进行分析,计算等位基因数目,鉴定单核苷酸多态性位点(single nuclear polymorphism,SNP).同时将序列导入Mega 4序列分析软件,计算错义突变率与同义突变率的比值(dN/dS),进行进化分析,构建进化树.结果 共抽提了60条日本血吸虫成虫的总RNA,其中46条通过RT-PCR获得了目的基因Sj-TSP2；序列分析共鉴定了20个等位基因,主要是由点突变引起,Sj-P2-10是优势等位基因.共鉴定了85个SNP位点,对应于63个密码子的变异,其中36个是同义突变,27个是错义突变,有22个错义突变发生在膜外大环结构域中.结论 Sj-TSP2基因高度变异,大多数突变存在膜外大环区,共鉴定了20个Sj-TSP2等位基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘卫庆	同济大学传染病与疫苗研究所	17	52	5.0	6.0
2	张丽丽	同济大学传染病与疫苗研究所	3	10	1.0	3.0
3	徐新东	同济大学传染病与疫苗研究所	3	5	1.0	2.0