水稻microRNA单核苷酸多态性

• 作者: 于颢 辛德东 郭卫东 闫旭
• 来源期刊: 中国水稻科学
• 学科: 农学
• 关键词: microRNA 水稻 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 467-474
• 分类号: Q74|S511
• 字数: 7409字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7216.2011.05.003

摘要

microRNA(miRNA)是一类内源性非编码小RNA,长度约22个核苷酸.miRNA通过与靶基因rnRNA特定位点结合,调控植物生长、发育和胁迫耐受性.pre-miRNA的单核苷酸突变会影响miRNA的成熟过程和调控功能,因此,研究miRNA基因中的单核苷酸多态性(SNP)分布对研究miRNA功能分化和基因进化有重要意义.为探讨水稻miRNA基因单核苷酸多态性及其潜在生物学意义,基于现有水稻SNP数据,分析f水稻pre-miRNA区、侧冀区(位于pre-miRNA上下游,与pre-miRNA等长的区间)的SNP分布.与已经报道过的绝大多数生物不同,SNP在水稻pre-miRNA区的频率与侧翼区无显著差异.进一步研究SNP在pre-miRNA二级结构中的分布,发现种子区SNP频率跟茎区、环区也无显著差异.然而,SNP在水稻基因区分布跟其他生物相似,即基因区SNP频率显著低于基因侧翼区.这可能暗示pre-miRNA侧翼区功能对miRNA非常重要,也可能与SNP在不同miRNA基因之间的分布不均衡有关,一部分miRNA基因正经历纯化选择压力放松,积累较多突变而成为新的基因或失去功能.但是以上结果并不排除是由于当前水稻SNP数据可靠性不高而导致的偏差.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭卫东	浙江师范大学化学与生命科学学院	70	884	16.0	27.0
2	于颢	浙江师范大学化学与生命科学学院	4	12	2.0	3.0
3	闫旭	浙江师范大学化学与生命科学学院	4	12	2.0	3.0
4	辛德东	浙江师范大学化学与生命科学学院	11	43	4.0	6.0