牙鲆微卫星标记遗传连锁图谱的构建

• 作者: 宋文涛 庞仁谊 廖小林 张潇峮 李文龙 梁卓 牛余泽 王磊 田永胜 赵永伟 邵长伟 陈松林
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 遗传连锁图谱 微卫星 分子标记辅助育种
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 981-987
• 分类号: S917.4
• 字数: 4476字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2011.06.001

摘要

为了实现分子标记或基因辅助育种在牙鲆养殖中成功运用,并快速提高牙鲆产量,使用微卫星标记首次构建了国内第一张牙鲆遗传连锁图谱.采用基因组测序的方法,筛选出大量微卫星序列,从中随机挑选1 000条序列设计合成引物,利用2009年建立的第10号家系为作图群体,使用JoinMap4.0软件,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)SSR标记遗传连锁图谱.雌雄图谱分别由24个连锁群组成,其中雌性图谱标记212个,总长度1 320.4 cM,覆盖率为77.7％；雄性图谱标记198个,总长度1361 cM,覆盖率为76.1％.每个连锁群长度变动在9.3～116.1 cM之间,连锁群上的标记数在3～21个之间.各连锁群上的SSR标记并不是均匀分布的,其中1、3和8号连锁群存在标记密集区.该图谱能够进行初步的QTL定位分析和基因定位相关研究,为开展牙鲆基因和QTL的精细定位及分子标记辅助育种(MAS)等提供更有效的依据.