利用线粒体COI序列分析4水系中华绒螯蟹群体遗传学特征

• 作者: 朱清顺 李晓晖 李跃华 柏如发 潘建林 葛家春 许志强
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 中华绒螯蟹 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ 不同水系 遗传特征
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 16-22
• 分类号: S917
• 字数: 5267字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00016

摘要

研究了长江、辽河、瓯江水系野生中华绒螫蟹(Eriiocheir sinensis)及其莱芮河水系F1共4个群体71个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)基因序列,比对长度包括628个位点,其中变异位点112个,简约信息位点36个.基因序列G+C(%)含量较低,表现出较为明显的碱基组成偏倚性.71个个体共含17种单倍型,单倍型H13出现次数最多,为莱芮河水系F1、长江以及瓯江群体共享;单倍型H15、H16和H17为瓯江群体特有.样本总体遗传多样性指数较高,其单倍型多样性指数(H)为0.862,核苷酸多样性指数(π)为0.0169.各水系野生群体遗传多样性分析表明,长江群体单倍型多样性指数最高(0.8380),莱茵河水系F1群体最低(0.7250);长江群体与辽河群体间遗传距离最小(0.00244),推测长江与辽河2群体间基因交流较多;长江群体内遗传距离(0.01738)大于除瓯江外的其他水系群体内遗传距离,揭示长江群体内遗传变异较大、种质混杂较严重.本研究中各群体间的基因流(Nm)均高于1,其中长江群体与辽河及莱茵河F1群体间的基因流分别为8.27和9.72,表明长江群体与这2个群体间曾经有较为频繁的基因交流.分子变异分析(AMOVA)结果显示,4个群体总的遗传分化指数为0.2685(P<0.001),其中90.77%遗传变异存在于各群体内部,9.23%变异存在于群体间.最小跨度网络图和系统发育分析均没有显示出单倍型与地理位置的对应关系,已不能形成明显的地理群体结构,证明当前各水系中华绒螯蟹种质混杂确实存在.