基于GBS技术的中华绒螯蟹的遗传特征分析

• 作者: 高祥刚 高美玲 鲍相渤
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 中华绒螯蟹 GBS SNP 遗传多样性 种群结构
• 年，卷（期）: 2017,（36）
• 所属期刊栏目: 动物科学·饲料科学
• 页码范围: 80-82
• 页数: 3页
• 分类号: S917.4
• 字数: 3167字
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究中华绒螯蟹经过多年的人工养殖、跨流域引种和增殖放流等活动可能会对其遗传特性造成的影响.[方法]基于下一代GBS测序技术,利用SNP标记对辽河家系、辽河野生、长江群体、海南群体、黄河群体进行遗传特征分析.[结果]经过条件为测序深度4×、Miss0.5、次要等位基因频率(MAF)>0.05的过滤后,共获得652746个高质量的SNP位点用于群体的遗传分析,各群体平均观测杂合度(Ho)为0.0844～0.1249,平均期望杂合度(He)为0.0974～0.2003,群体平均π值(Pi)为0.1583～0.2544,群体Fi的平均测量值(Fis)为0.0542～0.23843.两两群体间遗传分化指数Fst值结合系统发生树,可以看出,长江群体与海南群体的遗传距离较近,分化较小,表示海南的中华绒螯蟹苗种可能来自长江流域.[结论]该研究揭示了不同水系中华绒螯蟹的遗传差异,探讨了其遗传多样性水平,为中华绒鳌蟹资源的合理开发利用与保护提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高祥刚	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室	19	112	8.0	9.0
2	鲍相渤	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室	16	121	5.0	11.0
3	高美玲	大连工业大学食品学院	8	5	1.0	2.0