马尔尼菲青霉菌溶血磷脂酶基因的识别和序列分析及功能预测

• 作者: 唐小平 宋伟南 李凌华 胡凤玉 蔡卫平 陈万山
• 来源期刊: 国际流行病学传染病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 溶血磷脂酶 马尔尼菲青霉菌 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 73-77
• 分类号: R5
• 字数: 4137字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4149.2011.02.001

摘要

目的 从马尔尼菲青霉菌(PM)酵母相全长cDNA文库中识别溶血磷脂酶基因,预测其结构和功能,为进一步实验研究提供理论依据.方法 利用NCBI在线分析工具对PM酵母相全长cDNA文库进行筛选,识别溶血磷脂酶基因;通过Vector NTI suite 8.0软件包,对其编码蛋白质的各种结构与功能特征进行预测,并构建种系分子进化树.结果 筛选得到的基因长1014 bp,Blastx分析该基因可能是编码PM溶血磷脂酶的全长基因,完整的开放读码框(ORF)共含729 bp,编码243个氨基酸;其编码蛋白的相对分子质量为26 800,预测等电点为5.49,疏水氨基酸占47.7%,亲水氨基酸占26.8%,酸性氨基酸占12.7%,碱性氨基酸占12.8%;该蛋白有潜在的2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、3个蛋白激酶C磷酸化位点和7个N-肉豆蔻酰位点.结论 该氨基酸序列属于溶血磷脂酶样功能域特征蛋白酶;与球孢子菌亲源关系最近.通过研究,一个PM溶血磷脂酶基因被成功发现,这为进一步探讨该基因的功能提供了条件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐小平	广州医学院附属市八人民医院感染病科	7	22	2.0	4.0
2	蔡卫平	广州医学院附属市八人民医院感染病科	5	19	2.0	4.0
3	李凌华	广州医学院附属市八人民医院感染病科	3	2	1.0	1.0
4	胡凤玉	广州医学院附属市八人民医院感染病科	5	23	3.0	4.0
5	陈万山	广州医学院附属市八人民医院感染病科	2	2	1.0	1.0
6	宋伟南	广州医学院附属市八人民医院感染病科	2	2	1.0	1.0