白菜型油菜八氢番茄红素脱氢酶基因PDS3的克隆与序列分析

• 作者: 伍晓明 午鲲 薛蕾 闫贵欣 陈碧云 高桂珍
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 白菜型油菜 类胡萝卜素 八氢番茄红素脱氢酶基因BrPDS3
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 622-627
• 分类号: S565.403
• 字数: 3636字
• 语种: 中文

摘要

利用电子克隆技术,从数据库中找到与拟南芥高度同源的油菜EST序列,继而通过RT - PCR和RACE等方法,成功克隆了白菜型油菜八氢番茄红素脱氢酶(类胡萝卜素合成途径中的一个关键限速酶)基因PDS3的cDNA,命名为BrPDS3(GenBank登记号GQ200741).cDNA序列全长1 940bp,其中包含114bp的5'前导序列和134bp的3'不翻译序列,编码区长度为1 692bp,编码63kD的蛋白.序列分析表明,BrPDS3蛋白与其他植物的PDS蛋白具有较高相似性；在系统进化树中,BrPDS3与甘蓝亲缘关系最近.根据全长cDNA序列设计引物,从白菜型油菜青油13号DNA中克隆得到BrPDS3基因的全长DNA,长度为3 911bp,ORF(开放阅读框)1 692bp,含有15个外显子和14个内含子.