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北京汉族和约鲁巴人群ROR2基因单核苷酸多态性的比较研究
北京汉族和约鲁巴人群ROR2基因单核苷酸多态性的比较研究
作者:
王红
赵凯平
原文服务方:
北京大学学报医学版
多态性,单核苷酸
基因频率
ROR2基因
汉族
尼日利亚
摘要:
目的:比较北京汉族人群(CHB)和尼日利亚约鲁巴人群(YRI)ROR2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和单体域特征,为两组人群病因学研究中SNPs的确定和分析提供依据.方法:用Haploview 4.2软件对HapMap数据库中CHB和YRI人群ROR2基因SNPs数据进行分析和比较,两人群共同标签SNPs的确定由SPSS 13.0软件辅助完成.结果:HapMap计划在CHB和YRI人群分别测定了404和403个ROR2基因的SNPs,两人群均有5个SNPs分别位于第6或第9外显子区,其中rs10761129和rs 10820900等位基因的变化可导致错义突变.全部所测SNPs中,纯合基因型SNPs在CHB和YRI均为101个(25.6%),其中66个(65.3%)SNPs在两人群相同.YRI纯合基因型SNPs中,有两个SNPs(rs1135150、rs2230577)在CHB为合格SNPs且位于第9外显子区.CHB未测定的9个SNPs在YRI均为合格SNPs,YRI未测定的10个SNPs中,6个在CHB为合格SNPs.非纯合基因型SNPs中,排除各自不符合研究条件的36个和10个SNPs后,CHB和YRI均测定的293个SNPs中合格SNPs分别为257和283个.CHB和YRI人群214个共同合格的SNPs中有177个最小等位基因相同,其中最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)差值相对比<20%的为30个,占全部合格SNPs的11.4%和10.3%.214个共同合格SNPs在CHB和YRI中分别构建了18和26个单体域,除1个单体域在CHB和YRI完全重叠,CHB和YRI分别有2个和1个独立单体域外,其余单体域在两人群部分重叠.两人群各自合格SNPs中确定了44个共同标签SNPs,分别占各自标签SNPs的57.1%(CHB)和35.2% (YRI).结论:ROR2基因纯合基因型SNPs在HapMap所测CHB和YRI人群数据中占相当的比例.CHB和YRI人群ROR2基因SNPs在等位基因组成、MAF和单体域构成等方面以独特性为主,与人群地域和种族属性相一致.
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文献信息
篇名
北京汉族和约鲁巴人群ROR2基因单核苷酸多态性的比较研究
来源期刊
北京大学学报医学版
学科
关键词
多态性,单核苷酸
基因频率
ROR2基因
汉族
尼日利亚
年,卷(期)
2011,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
785-791
页数
分类号
R394.3
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1671-167X.2011.06.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
王红
北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
41
196
8.0
12.0
2
赵凯平
北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
4
5
2.0
2.0
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引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
多态性,单核苷酸
基因频率
ROR2基因
汉族
尼日利亚
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
北京大学学报医学版
主办单位:
北京大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-167X
CN:
11-4691/R
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1959-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
4664
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43895
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