烟草SSR分布特征与开发利用

• 作者: 薛金爱 赵彦宏
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 烟草 序列表达标签(EST) SSR GSS 引物
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 295-298,306
• 分类号: S572
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2011.04.01

摘要

EST-SSR标记与gSSR标记是2种重要的分子标记,烟草EST序列数量与基因组序列数量的迅速增加为开发新的烟草分子标记提供了宝贵的数据资源.对GenBank上公布的158098条EST序列及10 647条GSS序列进行大规模微卫星位点搜索,在EST中发现了8 088个微卫星位点(检出率为5.1%),在GSS中发现了2 020个微卫星位点(检出率为18.9%).在EST中搜索到的重复单元共有176种,其中二核苷酸占主导地位,占到总SSR的近66%,出现次数在1～100之间的基序超过所有基序的90%;在GSS中搜索到重复单元81种,出现次数大部分在1～50之间,占88%.研究还挑选了烟草的150条EST序列,并对其进行了引物的设计.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵彦宏	鲁东大学生命科学院	32	336	9.0	17.0
2	薛金爱	山西农业大学农学院	15	28	3.0	5.0