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16种常见凝固酶阴性葡萄球菌的快速分子鉴定
16种常见凝固酶阴性葡萄球菌的快速分子鉴定
作者:
刘朝军
李东冬
沈定霞
王凯飞
郭静
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
凝固酶阴性葡萄球菌
同源分析
16S rRNA
gap基因
摘要:
目的 建立对16种常见凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)的快速分子鉴定.方法 用gap基因对16种常见CNS进行扩增和测序,获得序列在GenBank进行比对,构建进化树进行同源分析,同时与16S rRNA基因比较.结果 16种常见CNS中,gap基因相似率介于39% ~ 98%,人葡萄球菌和与人葡萄球菌亚种相似率最高(98%),腐生葡萄球菌与木糖葡萄球菌相似率最低(39%),16SrRNA基因相似率介于96% ~ 99%,至少2种细菌99%以上相似率,最多4种葡萄球菌99%以上相似率;进化树同源分析显示,两种方法在检测缓慢葡萄球菌与松鼠葡萄球菌、产色葡萄球菌与中间葡萄球菌和人葡萄球菌与人葡萄球菌亚种时,都有很高的可信度(99%以上),而对于其他10种细菌,gap基因同源分析有较少的不可靠信度(49%,56%),16S rRNA基因同源分析有较多不可靠信度(43%、43%、50%、56%、63%、65%、76%).结论 gap基因序列分析能够对16种常见CNS进行准确鉴定,同源分析可信度要明显优于16S rRNA基因.
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文献信息
篇名
16种常见凝固酶阴性葡萄球菌的快速分子鉴定
来源期刊
中华微生物学和免疫学杂志
学科
医学
关键词
凝固酶阴性葡萄球菌
同源分析
16S rRNA
gap基因
年,卷(期)
2011,(12)
所属期刊栏目
免疫检测
研究方向
页码范围
1129-1132
页数
分类号
R446.6
字数
2401字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2011.12.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
郭静
中国人民解放军总医院微生物科
66
1210
14.0
34.0
2
沈定霞
中国人民解放军总医院微生物科
21
150
6.0
12.0
3
李东冬
中国人民解放军总医院微生物科
5
16
2.0
4.0
4
刘朝军
中国人民解放军总医院微生物科
2
4
2.0
2.0
5
王凯飞
中国人民解放军总医院微生物科
3
23
2.0
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二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
凝固酶阴性葡萄球菌
同源分析
16S rRNA
gap基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0254-5101
CN:
11-2309/R
开本:
大16开
出版地:
北京市经济技术开发区经海二路38号
邮发代号:
2-55
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
5865
总下载数(次)
10
总被引数(次)
26456
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