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摘要:
目的 建立对16种常见凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)的快速分子鉴定.方法 用gap基因对16种常见CNS进行扩增和测序,获得序列在GenBank进行比对,构建进化树进行同源分析,同时与16S rRNA基因比较.结果 16种常见CNS中,gap基因相似率介于39% ~ 98%,人葡萄球菌和与人葡萄球菌亚种相似率最高(98%),腐生葡萄球菌与木糖葡萄球菌相似率最低(39%),16SrRNA基因相似率介于96% ~ 99%,至少2种细菌99%以上相似率,最多4种葡萄球菌99%以上相似率;进化树同源分析显示,两种方法在检测缓慢葡萄球菌与松鼠葡萄球菌、产色葡萄球菌与中间葡萄球菌和人葡萄球菌与人葡萄球菌亚种时,都有很高的可信度(99%以上),而对于其他10种细菌,gap基因同源分析有较少的不可靠信度(49%,56%),16S rRNA基因同源分析有较多不可靠信度(43%、43%、50%、56%、63%、65%、76%).结论 gap基因序列分析能够对16种常见CNS进行准确鉴定,同源分析可信度要明显优于16S rRNA基因.
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文献信息
篇名 16种常见凝固酶阴性葡萄球菌的快速分子鉴定
来源期刊 中华微生物学和免疫学杂志 学科 医学
关键词 凝固酶阴性葡萄球菌 同源分析 16S rRNA gap基因
年,卷(期) 2011,(12) 所属期刊栏目 免疫检测
研究方向 页码范围 1129-1132
页数 分类号 R446.6
字数 2401字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2011.12.017
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郭静 中国人民解放军总医院微生物科 66 1210 14.0 34.0
2 沈定霞 中国人民解放军总医院微生物科 21 150 6.0 12.0
3 李东冬 中国人民解放军总医院微生物科 5 16 2.0 4.0
4 刘朝军 中国人民解放军总医院微生物科 2 4 2.0 2.0
5 王凯飞 中国人民解放军总医院微生物科 3 23 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
凝固酶阴性葡萄球菌
同源分析
16S rRNA
gap基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华微生物学和免疫学杂志
月刊
0254-5101
11-2309/R
大16开
北京市经济技术开发区经海二路38号
2-55
1981
chi
出版文献量(篇)
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10
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