南海赤潮亚历山大藻的分子鉴定及"塔玛复合种"的分子系统发生分析

• 作者: 刘晨临 刘胜浩 陈艳 黄晓航
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: "塔玛复合种" SSU rDNA ITS 条形码
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 163-169
• 分类号: X55
• 字数: 3381字
• 语种: 中文

摘要

利用SSu rDNA和ITS分子指标,结合GenBank和其他文献中的基因序列构建了系统树,对一株分离自我国南海的亚历山大藻"塔玛复合种"NH01进行了鉴定,发现SSU rDNA和ITS序列构建的系统树中,不同地理基因型的"塔玛复合种"均构成独立分支.与我国沿海所有的"塔玛复合种"一致,NH01也属于"亚洲温带"型.探讨了SSU rDNA和ITS分子指标用于塔玛和链状亚历山大藻鉴别的可行性,比较了2种不同的基于ITS序列的亚历山大藻的系统分类方法.认为SSU rDNA和ITS序列均可以应用于亚历山大藻种甚至种下水平的检测,可以准确判断其地理基因型.提出利用SSU rDNA和ITS等核酸序列标记的方法作为鉴定、调研我国海域的亚历山大藻"塔玛复合种"的常规手段.通过比对不同地理基因型的ITS序列,确定了一段DNA序列,可以用于鉴别不同地理基因型的亚历山大藻"塔玛复合种".