猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 朱小丽 朱晓琳 李兆龙 林锋强 王劭 程晓霞 陈仕龙 陈少莺
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪传染性胃肠炎病毒 M基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 925-929
• 分类号: S852
• 字数: 3305字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0384.2011.06.002

摘要

对猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)福建分离株(TGEV-FJ 株)M基因进行克隆、测序,并利用生物信息学技术分析TGEV-FJ株M蛋白基因的同源性、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点及其二级结构.结果显示,成功扩增出M基因完整目的片段(789 bp),编码262个氨基酸,构建了M基因的克隆重组质粒pGEM-T-M.序列分析与遗传进化树显示,TGEV M基因属高度保守的基因,TGEV-FJ株与HN2002株亲缘较近.TGEV-FJ株M蛋白具有一个潜在信号肽剪切位点(ACG16-17ER),存在3个潜在的N-糖基化位点,丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有6个、1个和5个；TGEV-FJ株M蛋白二级结构α-螺旋区域占11.59％,β-折叠区域占44.93％,无规则卷曲区域占43.48％.