油菜β-CT亚基编码基因accD的SNPs分析及其分子进化

• 作者: 付三雄 张洁夫 戚存扣 浦惠明 胡茂龙 陈松 陈锋 顾慧 高建芹 龙卫华
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 accD基因 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 7-11
• 分类号: S565.4
• 字数: 4826字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8581.2011.12.002

摘要

以含油量不同的32份甘蓝型油菜自交纯合系为材料,用直接测序法筛查β-CT亚基的accD编码基因DNA序列的单核苷酸多态性,包括98％的编码区序列共1380 bp.在32份材料中只在材料18和20两个材料中发现了一个相同的SNP,SNP频率为1/1380,单倍型多态性指数Hd =0.121；核苷酸多态性π=0.00009,θ=0.00018.Tajima’sD值为不显著负值,Fu&Li’s检测,各个参数均为不显著正值,Z检验结果中(dN -ds)值也为不显著正值,说明accD基因没有偏离中性进化.系统发育树表明,accD基因在所选的32个油菜材料中是高度保守的,与拟南芥的序列相似度高达95.7％,说明accD基因在物种间也是高度保守的.暗示其在种子油脂合成过程中起着不可替代的作用,此外说明,仅用β-CT亚基编码基因的单核苷酸多态性还不能解释含油量复杂的表现型,还需在更大的群体资源中扩增accD编码基因和其它亚基编码基因进行单核苷酸多态性与含油量表型的相关性研究.