甘蓝型油菜MADS-box基因家族的鉴定与系统进化分析

• 作者: 张云霄 胡胜武 郭媛 高虎虎
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 MADS-box 基因结构 进化 共线性
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 699-712
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11983/CBB16244

摘要

MADS-box基因家族参与调控开花时间、花器官分化、根系生长、分生组织分化、子房和配子发育、果实膨大及衰老等植物生长发育的重要过程.基于甘蓝型油菜(Brassica napus)基因组测序数据,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜MADS-box基因家族进行鉴定和注释及基因结构与系统进化分析.结果显示,在甘蓝型油菜中鉴定出307个MADS-box基因家族成员,根据进化关系可将其分为两大类型,Ⅰ型(M-type)包含α、β、γ三个亚家族,Ⅱ型(MIKC-type)包括MIKCc和MIKC*两个亚家族,MIKCc可进一步分为13个小类;甘蓝型油菜A基因组染色体上分布的MADS-box基因多于C基因组.在基因结构上,MIKC-type亚家族基因序列普遍比M-type长且含有较多的外显子;M-type亚家族蛋白序列中的motif数量为2-5个,MIKC-type亚家族蛋白序列中平均含有7个motif.拟南芥(Arabidopsis thaliana)与甘蓝型油菜MADS-box基因共线性分析结果显示,全基因组复制事件对MADS-box基因家族尤其是MIKC亚家族的扩张起重要作用;MIKC亚家族基因在进化过程中受到的选择压力约为M-type的2倍,这表明MIKC-type亚家族在进化过程中被选择性保留.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡胜武	西北农林科技大学农学院	54	597	16.0	22.0
2	郭媛	西北农林科技大学农学院	5	14	3.0	3.0
3	高虎虎	西北农林科技大学农学院	1	5	1.0	1.0
4	张云霄	西北农林科技大学农学院	2	8	2.0	2.0