甘蓝型油菜PEBP基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 荐红举 杨博 李阳阳 杨鸿 刘列钊 徐新福 李加纳
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 油菜 开花基因 PEBP 进化 表达
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 354-364
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2019.84095

摘要

植物磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein，PEBP)基因对于控制开花时间具有重要作用。油菜作为世界上最重要的油料作物之一，与模式植物拟南芥具有相似的开花习性。但有关油菜开花基因的功能研究相对较少。本研究利用拟南芥PEBP基因家族蛋白序列在油菜基因组内进行BlastP分析，获得油菜PEBP家族成员，并对其进行基因结构分析、motif预测、复制事件、进化树构建、选择压力分析和组织表达分析。结果表明，共有26个油菜PEBP基因成员得到鉴定，大部分成员含有4个外显子和3个内含子，motif-1和motif-2是PEBP成员的特征基序，超过76.9%的成员属于片段复制扩增事件。进化树分析显示，PEBP分为3个亚家族，基于转录组测序的组织表达数据表明油菜26个PEBP成员具有非常明显的组织表达特性。以上研究结果，极大丰富了我们对甘蓝型油菜开花基因及调控模式的认识，为进一步的分子育种提供了理论基础。