"鸟枪"蛋白组学技术鉴定牙龈卟啉单胞菌47A-1亚型外膜蛋白

• 作者: 孙俊毅 孙媛媛 李昂 苟建重
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 牙龈卟啉单胞菌 外膜蛋白 鸟枪法 蛋白质组学
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 页码范围: 170-174
• 分类号: R34|R37
• 语种: 中文

摘要

目的 利用shotgun(鸟枪)蛋白质组学策略鉴定牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis, P.g)亚型47A-1外膜蛋白,深化P.g外膜蛋白的蛋白质组学研究,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定基础.方法 提取P.g47A-1外膜蛋白,SDS-PAGE电泳分离蛋白,胶内酶解为多肽混合物,应用毛细管高效液相色谱加串联质谱分析,SEQUEST程序进行数据库搜索并鉴定蛋白.结果 用考马斯亮蓝法染色凝胶分离的蛋白,发现P.g47A-1蛋白条带主要在14.3～97ku之间.酶解的肽段经毛细管高效液相色谱分离,得到肽段水平的总离子流图,分析肽段序列后发现P.g47A-1蛋白有623个唯一肽段,鉴定出136种蛋白,包括了51种已知蛋白,85种未知蛋白.结论 Shotgun技术可分析出P.g47A-1大量未知蛋白,尤其是丰度低、疏水性强的外膜蛋白,优于二维凝胶电泳(two dimensional gel electrophoresis, 2-DE)等传统蛋白质组学方法,为进一步研究P.g外膜蛋白的致病性奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李昂	西安交通大学医学院附属口腔医院口腔医学研究中心	81	451	12.0	17.0
2	苟建重	西安交通大学医学院附属口腔医院牙周科	54	212	8.0	12.0
3	孙俊毅	西安交通大学医学院附属口腔医院牙周科	18	160	7.0	12.0
4	孙媛媛	烟台市口腔医院牙周科	3	7	1.0	2.0