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一例重症手足口病死亡患儿柯萨奇病毒B5型VP4区基因特征分析
一例重症手足口病死亡患儿柯萨奇病毒B5型VP4区基因特征分析
作者:
刘国涛
吉彦莉
王永全
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
手足口病
柯萨奇病毒B5型
进化分析
摘要:
目的:对一例重症手足口病死亡患儿肠道病毒型别进行鉴定,分析VP4区基因特征,了解其变异情况.方法:提取病毒RNA,用肠道病毒VP4区分型引物进行半巢式RT-PCR(RT-nPCR),通过测序和Blast比对确定肠道病毒型别;并对其VP4区进行序列和进化分析.结果:RT-nPCR扩增目的片段测序结果经Blast比对确定为柯萨奇病毒B5型(CoxB5),命名为BJ09-237 (Genbank登录号为JF430480).其VP4区全长207bp,与CoxB5参考序列在VP4区的核苷酸同源性为79%~98%,氨基酸同源性为95%~100%,与广东株HQ005438及俄罗斯株GQ281602在同一进化树分支上.BJ09-237在VP4区无氨基酸的缺失和插入,未发现其所特有的氨基酸置换.结论:该重症手足口病死亡患儿CoxB5的VP4区基因序列未发生明显变异.
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文献信息
篇名
一例重症手足口病死亡患儿柯萨奇病毒B5型VP4区基因特征分析
来源期刊
中国卫生检验杂志
学科
医学
关键词
手足口病
柯萨奇病毒B5型
进化分析
年,卷(期)
2011,(10)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
2377-2378,2381
页数
3页
分类号
R373.2
字数
语种
中文
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手足口病
柯萨奇病毒B5型
进化分析
研究起点
研究来源
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研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国卫生检验杂志
主办单位:
中华预防医学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1004-8685
CN:
41-1192/R
开本:
大16开
出版地:
郑州市经一路12号
邮发代号:
80-152
创刊时间:
1991
语种:
chi
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21668
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