柯萨奇病毒B5河南分离株全基因组序列测定及分析

• 作者: 晁灵 李幸乐 许汴利 许玉玲 陈豪敏 黄学勇
• 来源期刊: 郑州大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒B5 全基因组序列 基因特征
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 868-871
• 分类号: R373.2
• 字数: 2861字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6825.2011.06.017

摘要

目的:了解柯萨奇病毒B5( CoxB5)河南分离株全基因特征及与其他肠道病毒基因的关系.方法:采用RT-PCR扩增全基因,采用DNAStar中的SeqMan拼接所测序列,BioEdit进行同源性比较,Simplot进行相似度分析.结果:CoxB5/Henan/2010基因组全长7 401 bp.与原型株Faulkner相比,编码区氨基酸同源性为95.6％,核苷酸同源性为79.9％,其中VP4-VP2核苷酸差异为17.8％～20.4％,VP1核苷酸差异为19.5％,P2、P3核苷酸差异分别为19.5％、21.7％.不同型别肠道病毒间VP4-VP2核苷酸差异为14.4％ ～ 34.9％,VP1核苷酸差异为18.3％～42.3％,P2、P3核苷酸差异为17.1％～21.0％、15.5％ ～ 22.6％.结论:与原型株相比,CoxB5/Henan/2010株编码区发生沉默突变,其核苷酸变异并不影响氨基酸序列的变化；肠道病毒基因组各分区在进化中不同步.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许汴利	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	148	1187	16.0	24.0
2	李幸乐	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	31	186	9.0	11.0
3	陈豪敏	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	58	514	12.0	18.0
4	黄学勇	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	93	505	10.0	17.0
5	许玉玲	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	23	38	4.0	5.0
6	晁灵	河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所	1	7	1.0	1.0