猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析

• 作者: 张立宪 张青娴 徐引弟 朱文豪 李海利 焦文强 王克领 王治方 许峰 郎利敏
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 CH-HeNXX-2017株 全基因组序列
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医
• 页码范围: 113-116,120
• 页数: 5页
• 分类号: S858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.01.28

摘要

为了解猪流行性腹泻病毒在河南流行毒株全基因组遗传进化水平,应用RT-PCR方法从疑似猪流行性腹泻病毒感染的病料中扩增出全基因组序列,并将PCR产物纯化后连接pMD20-T载体,转化JM109感受态细胞,挑选单克隆进行测序,获得的序列经过DNA STAR中Edit Sequence软件对全基因组序列进行拼接.结果表明,猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全长28 038 nt(除去poly A);进化树分析显示,该毒株与IA1,USA Colorado2013,MN和PC22A等毒株亲缘关系较为接近,与国内外早期分离株如CV777,LZC,DR13等毒株亲缘关系较远.揭示猪流行性腹泻病毒一直处于不断的进化中,需要一直密切监控病毒进化趋势,为临床诊断以及疫苗研发等提供理论参考.