猪流行性腹泻病毒SD2014株全基因组序列测定与遗传演化分析

• 作者: 周磊 徐发荣 李栋梁 赵景义 陈艳红 高翔
• 来源期刊: 中国兽医杂志
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 全基因组序列 遗传演化
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 12-15
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65+1
• 语种: 中文

摘要

为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)在国内的流行及变异情况,对2014年在山东省某猪场流行的PEDV毒株SD2014进行全基因组测序,并与国内外代表毒株进行序列比对、同源性分析和遗传演化分析.结果表明,SD2014毒株全长28,036 nt(除去PolyA).遗传演化分析显示该毒株与美国分离株OH851以及我国2010年后分离的变异毒株属于同一分支.通过对S基因和ORF3序列进行对比,发现SD2014与我国早期分离株BJ-2011-1变异位点相似,且与欧美毒株和疫苗株(CV777)差异明显.提示自2010年PED暴发后,与疫苗株差异较大的变异株仍在国内流行,该病防控形势依然严峻.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈艳红	中国农业大学动物医学院	72	1205	19.0	32.0
2	高翔	中国农业大学动物医学院	16	68	4.0	8.0
3	周磊	中国农业大学动物医学院	34	175	7.0	12.0
4	赵景义		6	6	2.0	2.0
5	徐发荣		3	9	3.0	3.0
6	李栋梁		1	3	1.0	1.0