2014-2018年猪流行性腹泻病毒N基因遗传变化分析

• 作者: 刘运超 张改平 徐引弟 李海利 焦文强 王克领 王治方 邢广旭
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 N基因 分子流行病学 序列分析
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医
• 页码范围: 1830-1833,1837
• 页数: 5页
• 分类号: S858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.10.33

摘要

为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)N基因的分子流行病学情况,采用RT-PCR方法对2014-2018年采集到的河南、河北、山东、山西、甘肃、湖北、江西以及上海8省市共205份疑似PEDV阳性病料进行PEDV检测,使用RT-PCR方法扩增得到PEDV的N基因片段,回收PCR产物并与pMD20-T载体进行连接,挑选阳性克隆进行测序,分析研究PEDV遗传变异情况.结果 显示,205份样品中,有191份样品为PEDV阳性,共得到19株PEDV的N基因序列,N基因全长均为1 326 bp,没有碱基的缺失和插入;将检测到的PEDV的N基因序列与国内外分离株进行比对发现,核苷酸的同源性为94.8％～99.5％,氨基酸的同源性为95.0％～99.3％.进化树分析发现,得到的19株N基因序列与CV777、CH-S等国内外毒株亲缘关系较远;其中,16株与MN、USA-Indiana-2013、USA-Iowa 107-2013等近年分离株在一个分支上,为G2a亚群;CH-HENWZ-2015、CH-HENPY-2014、CH-HENZMDPY-2017这3株序列形成另一个分支,为G2b亚群.综上可知,我国PEDV流行广泛,病毒变异频繁.研究结果可为新型疫苗研发以及检测方法的建立奠定基础.