猪圆环病毒2型HB-MC1株全基因组序列测定与分析

• 作者: 孙继国 左奕 袁万哲
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 猪圆环病毒2型 全基因组 序列测定 变异分析
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 98-102
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2015.0018

摘要

参照发表的猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2，PCV2）全基因组序列，设计合成了1对特异性引物，对2014年从河北省满城县某发病猪场分离到的1株PCV2（命名为HB‐MC1）的全基因组进行了序列测定。应用DNAStar序列分析软件，对所测序列与GenBank中登录的 PCV2序列进行同源性比较，结果显示，HB‐MC1株的基因组全长为1767 nt ，其ORF1序列与GenBank登录的一些具有代表性的PCV2参考序列同源性高达97．2％～99．9％，其ORF2同源性在89．9％～99．6％之间。进化树分析结果显示，该毒株为 PCV2d亚型，毒株部分核苷酸位点显示其属于强毒力毒株。研究结果揭示了 HB‐M C1株基因组特征与基因亚型，丰富了PCV2的基因组信息数据。