SARS冠状病毒PUMC01分离株的基因组序列分析

• 作者: 丁克越 于占霞 倪安平 刘勇 刘湘军 周鑫峰 张文 强伯勤 彭晓忠 朱华 杨剑 樊峥 沈岩 王仲 王婷 秦川 邹柯 魏国柱
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 严重急性呼吸综合征 冠状病毒 基因组
• 年，卷（期）: 2003,（5）
• 所属期刊栏目: SARS专栏
• 页码范围: 495-498
• 页数: 4页
• 分类号: R373.1|Q522+.6
• 语种: 中文

摘要

目的对北京协和医院分离的SARS冠状病毒(SARS-CoV)PUMC01株的基因组序列进行变异及系统发育分析.方法利用随机引物法构建SARS-CoV-PUMC01分离株的cDNA文库,随机挑选质粒克隆进行大规模测序,测序反应经过组装后获得全基因组序列(Genbank Accession No.,AY350750),对该序列与SARS-CoV的参考序列相比进行系统发育及变异分析.结果与参考序列(SARS-CoV-Tor2及SARS-CoV-Urbani)相比较,在SARS-CoV-PUMC01上共发现10个变异位点;与其他的17株SARS-CoV进行系统发育分析后发现,18株SARS-CoV分为两类,两类之间及每一类的各株病毒间具有不同的分化时间.结论了解不同地区SARS-CoV之间的系统发育关系,为系统了解不同SARS-CoV分离株之间的临床关系以及SARS-CoV的传播链提供了进化上的证据.