橡胶树水通道蛋白基因HbPIP1;2和HbPIP2;2的克隆及序列分析

• 作者: 喻修道 安锋 庄海燕 张硕新 黄娟
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 橡胶树 水通道蛋白 PCR RACE 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与栽培
• 页码范围: 56-61,113
• 分类号: S794.104
• 语种: 中文

摘要

根据GenBank中已经公布的不同植物水通道蛋白(AQPs)的保守氨基酸序列设计简并引物,结合RT-PCR和RACE技术,从橡胶树(Hevea brasiliensis)中克隆了2个AQP基因的全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析.结果获得橡胶树2个AQPs基因的全长,分别命名为HbPIP1；2和HbPIP2;2.HbPIP1；2编码273个氨基酸,理论分子量为29.15 kD,等电点为8.55；HbPIP2；2编码278个氨基酸,理论分子量为29.78 kD,等电点为8.20.HbPIP1；2和HbPIP2;2均具有6个跨膜区和MIP家族信号序列SGXHXNPAVT,为疏水性蛋白；HbPIP1;2和HbPIP2;2与同科蓖麻水通道蛋白基因RcPIP1 -3和RcPIP2-1的同源性分别为91％和89％,并具有相同功能域.因此,推测Hb-PIP1；2和HbPIP2;2都属于水通道蛋白基因家族的新成员.