应用DGGE技术分析自然免耕土与普通耕作土细菌群落的多样性

• 作者: 周泽扬 张时恒 李田 潘国庆 贾俊杰 马振刚 马淑华
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 免耕土 DGGE 16S rDNA 细菌群落 自净能力
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 土壤肥料·资源环境
• 页码范围: 1273-1278
• 分类号: S154.38+.1
• 字数: 4051字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2011.06.018

摘要

为探明免耕土壤与普通耕作土壤环境中细菌群落的多样性,获取相关优势菌落信息,该研究利用宏基因组学方法获得免耕土和普通耕作土样品总DNA,利用PCR获得16SrDNAV3片段,并进行变性梯度凝胶电泳(Denaturation gradient gel electrophoresis),通过微生物种群丰富度比较两样品中群落的丰富性,同时选取相关DNA条带进行克隆、测序和生物信息学分析.结果显示:免耕土壤中细菌群落多样性更加丰富；两类型土壤样品间细菌群落组成具有显著差异,证明耕作制度影响了土壤细菌群落结构.BLAST分析与系统发生分析结果表明,免耕土壤中特异存在的细菌群落与具有生物固氮、降解甲苯和倍硫磷等特性的细菌序列相似性较高或进化关系较近,推测其在免耕土壤肥力、有毒物质降解及有机质转变等过程中起作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周泽扬	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	59	388	9.0	17.0
5	潘国庆	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	44	197	8.0	11.0
6	李田	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	26	114	6.0	10.0
7	马振刚	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	8	26	3.0	4.0
8	贾俊杰	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	4	13	2.0	3.0
9	马淑华	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	3	28	2.0	3.0
10	张时恒	西南大学农业部蚕桑学重点实验室	2	10	2.0	2.0