Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶的生物信息学分析

• 作者: 曾建涛 李泉
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶 同源建模 分子对接
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1300-1302
• 分类号: Q566+.4
• 语种: 中文

摘要

目的 应用生物信息学方法分析Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶(New Delhi metallo-β-1actamase 1,NDM1)的基本性质,并与常见的β内酰胺类抗生素进行分子对接,在理论上研究NDM1对β内酰胺类抗生素和抑制剂的水解活性.方法 应用EMBOSS 6.3.1.1软件包的程序分析NDM1的基本性质,并分别利用SWISS-MODEL同源建模和PHYRE 2.0折叠识别法构建NDM1的空间结构,再运用Arguslab 4.0软件的dock模块进行β内酰胺类抗生素与NDM1分子对接.结果 NDM1共270个氨基酸残基,理论等电点为6.3,包含1个跨膜区,α螺旋占27％,β折叠占34.5％；与抗生素对接能量由低到高依次为氨苄西林、头孢拉啶、阿莫西林、头孢唑林、甲氧西林、美罗培南、亚胺培南、氨曲南、克拉维酸.结论 NDM1对氨苄西林催化效率最高,对氨曲南催化效率最低,克拉维酸对NDM1无抑制作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李泉	重庆市长寿区人民医院检验科	31	98	6.0	8.0
2	曾建涛	重庆市长寿区人民医院检验科	12	21	3.0	4.0