基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因

• 作者: 刘辉 吕国栋 惠艳 林仁勇 王慧 王星 王晓东
• 来源期刊: 中华皮肤科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肉瘤,卡波西 寡核苷酸序列分析 基因表达谱 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 403-406
• 分类号: R739.502
• 字数: 3156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2011.06.008

摘要

目的 筛选Kaposi肉瘤相关基因.方法 新疆本地1例经典型Kaposi肉瘤患者,提取病灶组织及正常皮肤组织的总RNA,逆转录成cDNA,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的方法检测Kaposi肉瘤相关疱疹病毒(Kaposi sarcoma-associated herpersivims,KSHV)基因K8.1、K2、ORF50在组织中的表达来确定所取标本有无交叉污染.随后进行荧光标记制备探针,与含有25100条人类基因的35KcDNA基因表达谱芯片进行杂交,用扫描仪扫描芯片荧光信号图像,并用软件对扫描图像进行数字化处理和分析.结果 RT-qPCR检测到KSHV基因在Kaposi肉瘤病灶组织中的存在,而正常皮肤组织中未检测到,说明样本取材无交叉污染.在25 100个基因中,共有1313条差异基因,其中756条基因表达上调,557条基因表达下调.差异表达显著的基因涉及细胞凋亡、血管发生、细胞信号传导、蛋白加工和细胞周期调节等,如髓样细胞白血病-1基因(MCI-1)、膜联蛋白基因、丝氨酸蛋白酶抑制剂(SPINK5)基因等.结论 MCI-1、SPINK5等基因可能与Kaposi肉瘤的发病有关联.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林仁勇	新疆医科大学第一附属医院医学研究中心	64	328	11.0	16.0
2	惠艳	新疆医科大学第一附属医院皮肤科	71	233	8.0	11.0
3	刘辉	新疆医科大学第一附属医院医学研究中心	32	124	6.0	10.0
4	王慧	新疆医科大学第一附属医院医学研究中心	19	38	4.0	5.0
5	吕国栋	新疆医科大学第一附属医院医学研究中心	31	50	4.0	6.0
6	王晓东	新疆医科大学第一附属医院皮肤科	27	35	4.0	5.0