南海球形棕囊藻质体16S rDNA序列分析

• 作者: 司从利 章群 马奔 黄小彧
• 来源期刊: 生态环境学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 赤潮 棕囊藻 质体16S rDNA
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 页码范围: 1898-1901
• 分类号: X173
• 字数: 2523字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5906.2011.12.020

摘要

测定了采自香港2株球形棕囊藻和湛江1株等鞭金藻质体16S rDNA基因序列,结合GenBank中下载的32条同源序列,分析序列特征并构建分子系统树.发现600 bp序列中有可变位点42个,简约信息位点33个,可变位点和简约信息位点分别为全序列的7.0％和5.5％.A+T的含量(52.5％)略大于C+G含量(47.5％),与已报道的棕囊藻属叶绿体和线粒体基因相似；在分子系统树上,同属藻种聚类在一起,属间遗传距离分别为0.025 5～0.050 3.棕囊藻属属内遗传距离0-0.005 0,不同藻种相混杂,并未独立成支；质体16s rDNA部分序列虽不能区分棕囊藻属内不同藻种,但能鉴定出GenBank中27个环境样品为棕囊藻属藻株,从而能确定其地理分布和相对丰度,对棕囊藻赤潮的预测预报具有重要意义.质体16srDNA在其他赤潮藻类物种鉴定方面的应用需要进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学水生生物研究所	86	843	17.0	23.0
2	马奔	暨南大学水生生物研究所	9	41	4.0	6.0
3	黄小彧	暨南大学水生生物研究所	7	37	4.0	6.0
4	司从利	暨南大学水生生物研究所	6	37	4.0	6.0