广西巴马小型猪内源性反转录B亚型病毒5′非编码区的序列扩增及分析

• 作者: 刘文娟 吴健敏 欧阳康 白安斌 郭亚芬 陈凤莲 马玲
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪内源性反转录病毒 广西巴马小型猪 RACE 5'UTR
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 24-28
• 分类号: S855.3
• 字数: 4031字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2011.01.005

摘要

应用SMART RACE方法快速扩增广西巴马小型猪内源性反转录病毒(PERV)5'非编码区,获得了一条长度为1 423 bp的PERV-5'UTR序列(GenBank登录号GU390231),该序列与GenBank已发表的PERV-A、B、C各亚型同源性分别为92.4%～95.2%、91.8%～99.5%和86.5%～92.6%,遗传进化树分析,扩增序列为B亚型PERV-5'UTR.一级结构分析表明,该序列由U3、R、U5、PBS和LEADER 5个区域构成,与GenBank已发表的其他序列相比缺少344 bp.通过plantCARE数据库鉴定,GU390231序列得到28个有效的顺式作用元件,推测这些元件对PERV的转录起着或正或负的调控作用.本试验获得的PERV-B亚型5'UTR序列对进一步研究广西巴马小型猪PERV-B亚型病毒的转录调控机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭亚芬	广西大学动物科学技术学院	113	570	9.0	20.0
2	吴健敏		14	74	5.0	8.0
3	欧阳康		15	33	4.0	5.0
5	刘文娟		5	4	1.0	2.0
6	白安斌		6	37	3.0	6.0
7	陈凤莲		7	14	3.0	3.0
8	马玲		8	26	3.0	5.0