小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单核苷酸多态性分析及其定位

• 作者: 岳爱琴 昌小平 景蕊莲 李昂 李润植 毛新国 贾继增
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 6-SFT-A 单核苷酸多态性 抗旱性 单倍型 遗传作图
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 2216-2224
• 分类号: S512.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.11.002

摘要

[目的]小麦果聚糖合成酶基因6-SFT是果聚糖合成过程中的关键酶基因,研究6-SFT-A的多态性,分析其与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位.[方法]以苗期抗旱性不同的30份六倍体小麦和4份小麦A基因组供体种乌拉尔图小麦为材料,通过直接测序分析6-SFT-A的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系;开发基因分子标记,利用RIL群体(偃展1号×内乡188)对该基因进行遗传定位.[结果]在30份六倍体小麦材料中检测到14个核苷酸多态性位点,包括13个SNP和1个InDe1,平均234 bp检测到一个多态性位点,仅在1 727和1 781 bp 2个位点检测到非同义突变;在4份乌拉尔图小麦中检测到28个SNP和4个InDel,其频率明显高于普通小麦.该基因的内含子1、2、3和外显子3为变异富集区,其它区域变异较小,外显子2变异最小,π值为0.34份材料分为3种单倍型,Hap1 I主要包括中等抗旱材料和水敏感材料,Hap1Ⅲ中主要包括强抗旱材料和中等抗旱材料.利用RIL群体将该基因定位于染色体4A的标记Xcwm-27与Xwpt688之间,遗传距离分别为5.3和7.9 cM.[结论]单倍型分析表明,小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单倍型与小麦苗期抗旱性有一定的相关性.