样品沉淀方法对线粒体蛋白指纹图谱分析影响

• 作者: 刘华 姜伟 杨永长 肖代雯 闫慧 韵雪雪 黄文芳
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: Au芯片 线粒体蛋白 丙酮沉淀 三氯醋酸-丙酮沉淀 饱和(NH4)2SO4沉淀
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1119-1121
• 分类号: R 114
• 语种: 中文

摘要

目的 比较不同方法沉淀乳腺癌线粒体蛋白对Au芯片分析的影响,为Au芯片研究亚细胞蛋白奠定基础.方法 提取体外培养乳腺癌细胞MCF-7的线粒体蛋白,分别采用丙酮沉淀,三氯醋酸-丙酮(TCA-丙酮)沉淀,饱和( NH4)2SO4沉淀处理样品,点样Au蛋白芯片,表面增强激光解析蛋白飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析蛋白指纹图谱,Biomaker Wizard Software分析软件收集数据.结果 每种方法均重复试验20次,在质荷比(m/z)2000～100 000范围内检测蛋白点数目,统计结果分别为TCA-丙酮沉淀39个,丙酮沉淀71个,饱和(NH4 )2SO4沉淀14个；选择8.6、10.0、11.3、14.0和15.6kD 5个含量较高的蛋白作为标志,采用q检验进行两两分析,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 对分子量(Mr) ＜11 kD的蛋白,丙酮沉淀处理可以获得较好的蛋白指纹图谱,对Mr＞11kD的蛋白TCA-丙酮沉淀处理结果好,综合使用2种方法分别处理样品上样Au芯片可以获得好的线粒体蛋白分析结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄文芳	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	40	129	6.0	9.0
2	刘华	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	30	138	6.0	10.0
3	姜伟	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	17	55	4.0	6.0
4	肖代雯	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	18	58	4.0	6.0
5	杨永长	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	26	63	4.0	6.0
6	闫慧	重庆医科大学医学检验系临床检验诊断学教育部重点实验室	6	8	1.0	2.0
7	韵雪雪	四川省医学科学院四川省人民医院检验科	1	1	1.0	1.0