崂山奶山羊分子系谱的构建及家系遗传特征分析

• 作者: 王勇 王建民 王桂芝 王金凤 程明 纪志宾 赵金山 陈珊珊
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 微卫星 奶山羊 亲权鉴定 分子系谱 遗传特征
• 年，卷（期）: 2011,（13）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 2796-2807
• 分类号: S827.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.13.018

摘要

[目的]通过微卫星 DNA 标记技术对已知系谱记录的试验群体构建分子系谱,验证崂山奶山羊与原有系谱记录的一致性,探讨影响亲权鉴定的因素,摸清家系的遗传特征,为群体的保种和遗传管理提供科学依据.[方法]从25个微卫星DNA标记中筛选出12个高多态性的遗传标记,对已知系谱记录的212只崂山奶山羊,利用Cervus VS 2.0软件进行亲权分析,利用Pedigraph VS 2.2软件构建试验群体的分子系谱,利用Molkin VS 3.0、MEGA4 和 GeneClass2 软件对所构建家系的遗传特征及系统发育关系进行分析.用SPSS VS 16 软件对每个位点的排除概率(EP)与多态信息含量(PIC)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、等位基因数(K)等多态性参数的相关性进行分析,分析不同位点数及信息来源对亲权鉴定准确性的影响.[结果]12个微卫星DNA遗传标记的多态信息含量均为高度多态(PIC≥0.5),平均为0.687,平均等位基因数为5.75个,期望杂合度平均为0.730;在父本已知的基础上进行母子亲权鉴定,置信度在95%以上的累积排除概率为0.9998,最终从80个候选母亲、祖母中找出了115个后裔的母亲、祖母,发现3个个体与原有系谱记录不相符,符合度达到98.58%,构建了2个以父系为基础的家系及群体分子系谱图.排除概率与PIC相关系数最大(0.99以上),与K相关系数最小(0.67).使用8个位点可使CEP2达到99.73%以上.[结论]所选12个微卫星标记可用于崂山奶山羊试验群体的亲权鉴定及分子系谱构建;所构建家系具有较好的遗传基础,家系间及家系内具有较高的遗传变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建民	山东农业大学动物科技学院	82	841	16.0	25.0
2	程明		67	326	9.0	13.0
3	赵金山		44	207	8.0	11.0
4	王桂芝	山东农业大学动物科技学院	48	480	10.0	21.0
5	纪志宾	山东农业大学动物科技学院	5	234	4.0	5.0
6	王勇	山东农业大学动物科技学院	13	147	6.0	12.0
7	王金凤	山东农业大学动物科技学院	3	25	3.0	3.0
8	陈珊珊	山东农业大学动物科技学院	2	20	2.0	2.0