应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型

• 作者: 刘斌 张少红 赵均良
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 SSR标记 InDel标记 SNP标记 高分辨率熔解曲线
• 年，卷（期）: 2011,（18）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种、种质资源、分子遗传学
• 页码范围: 3701-3708
• 分类号: S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.18.001

摘要

[目的]验证高分辨熔解曲线(high-resolution melting curve analysis,HRM)技术在水稻分子标记分析中应用的可行性和可靠性,应用该技术对水稻重组自交系(RIL)群体及其亲本进行SSR、InDel和SNP标记基因型分析.[方法]以粳稻品种丽江新团黑谷(LTH)和籼稻品种三黄占2号(SHZ-2)及其衍生的RIL群体为材料,以纯合亲本LTH作为参比基因型,利用HRM技术分析一个G/A转换的SNP标记以及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)难以分辨的一个SSR标记和一个InDel标记的基因型.[结果]通过加入适量的参比DNA,HRM能够分辨2个纯合亲本及其衍生的纯合体和杂合体RI系的分子标记基因型,并且以加入20％模板量的参比DNA对3种基因型的分辨最好.利用该方法对作图群体的部分RI系进行分子标记基因型分析,结果与变性PAGE的分析结果完全吻合.[结论]验证了HRM应用于水稻SSR、InDel以及SNP标记分析的可行性和可靠性.相对于凝胶电泳分析,HRM具有分辨率高、高效、快速、操作简单、安全等优点,是一种在水稻分子标记分析中很有应用前景的技术.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘斌	广东省农业科学院水稻研究所	18	294	8.0	17.0
2	张少红	广东省农业科学院水稻研究所	8	208	6.0	8.0
3	赵均良	广东省农业科学院水稻研究所	2	22	1.0	2.0