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摘要:
[目的]基于转录组水平分析芜菁雌蕊退化突变(turnip pisti1 aborted,tpa)发生的可能原因,为揭示芸薹属作物雌蕊发育的分子遗传调控机制提供研究依据.[方法]利用tpa及其野生型植株的开放花制备的mRNA反转录成cDNA与拟南芥ATH1芯片进行杂交,筛选出在tpa及其野生型植株中表达有差异的基因,并利用RT-PCR技术对芯片筛选出的基因进行验证.[结果]获得了152个在野生型(W1)和完全退化株(M3)转录组中差异表达的基因,61个在W1和部分退化株(12)转录组中差异表达的基因,以及24个在I2和M3转录组中差异表达的基因,上述差异基因分别属于细胞壁合成与调控、防卫与胁迫反应、转录调控、蛋白质代谢以及普通新陈代谢等9个不同的功能类别.通过对41个基因的RT-PCR验证,获得了At2g42840.At1g57750.At5g20630,At2g03090,At3g08030.At5g08000,At2g28790,At5g63310和At2g24270等9个在tpa及野生型植株中具显著不同的时空表达特性的基因.[结论]拟南芥cDNA芯片可用于分析tpa及其野生型基因的转录差异,筛选获得的9个显著差异基因不但在雌蕊发育等生殖发育过程起重要作用,还参与了植物营养生长的生理生化过程.
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文献信息
篇名 基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体tpa及野生型开放花的转录组差异
来源期刊 中国农业科学 学科 农学
关键词 芜菁 拟南芥cDNA芯片 雌蕊发育 基因表达 转录
年,卷(期) 2011,(5) 所属期刊栏目 园艺
研究方向 页码范围 972-981
页数 分类号 S631.3
字数 语种 中文
DOI 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.05.014
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 余小林 浙江大学蔬菜科学研究所/农业部园艺植物生长发育与品质调控重点开放实验室 52 859 16.0 28.0
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中国农业科学
半月刊
0578-1752
11-1328/S
大16开
北京中关村南大街12号
2-138
1960
chi
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