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基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体tpa及野生型开放花的转录组差异
基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体tpa及野生型开放花的转录组差异
作者:
余小林
卢海宇
吴剑锋
张海娟
王芳展
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
芜菁
拟南芥cDNA芯片
雌蕊发育
基因表达
转录
摘要:
[目的]基于转录组水平分析芜菁雌蕊退化突变(turnip pisti1 aborted,tpa)发生的可能原因,为揭示芸薹属作物雌蕊发育的分子遗传调控机制提供研究依据.[方法]利用tpa及其野生型植株的开放花制备的mRNA反转录成cDNA与拟南芥ATH1芯片进行杂交,筛选出在tpa及其野生型植株中表达有差异的基因,并利用RT-PCR技术对芯片筛选出的基因进行验证.[结果]获得了152个在野生型(W1)和完全退化株(M3)转录组中差异表达的基因,61个在W1和部分退化株(12)转录组中差异表达的基因,以及24个在I2和M3转录组中差异表达的基因,上述差异基因分别属于细胞壁合成与调控、防卫与胁迫反应、转录调控、蛋白质代谢以及普通新陈代谢等9个不同的功能类别.通过对41个基因的RT-PCR验证,获得了At2g42840.At1g57750.At5g20630,At2g03090,At3g08030.At5g08000,At2g28790,At5g63310和At2g24270等9个在tpa及野生型植株中具显著不同的时空表达特性的基因.[结论]拟南芥cDNA芯片可用于分析tpa及其野生型基因的转录差异,筛选获得的9个显著差异基因不但在雌蕊发育等生殖发育过程起重要作用,还参与了植物营养生长的生理生化过程.
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文献信息
篇名
基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体tpa及野生型开放花的转录组差异
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
芜菁
拟南芥cDNA芯片
雌蕊发育
基因表达
转录
年,卷(期)
2011,(5)
所属期刊栏目
园艺
研究方向
页码范围
972-981
页数
分类号
S631.3
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2011.05.014
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
余小林
浙江大学蔬菜科学研究所/农业部园艺植物生长发育与品质调控重点开放实验室
52
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16.0
28.0
传播情况
被引次数趋势
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雌蕊发育
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期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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