基因组偏好影响细菌直系同源蛋白质组成

• 作者: 孙超 杨健 陶士珩 韩岗 马婧
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 基因组GC含量 直系同源蛋白 氨基酸组成
• 年，卷（期）: 2011,（26）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 15848-15854
• 分类号: S188
• 字数: 6202字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2011.26.006

摘要

从KEGG数据库中获得69种细菌的139组直系同源蛋白质序列,对它们的氨基酸组成及全基因组GC％含量与氨基酸组成关系进行各种分析.结果表明:核酸组成偏好对直系同源蛋白质的组成有极显著影响；不同功能类型的直系同源蛋白质氨基酸组成均受核酸GC％含量影响,氨基酸的组成受到选择压力与突变压力的双重影响.同时还指出,亲缘关系近的物种之间具有比全基因组GC％含量相近的物种之间更相似的直系同源蛋白质氨基酸组成.研究结果对于今后在各种研究中使用直系同源序列进行各种生物信息等相关分析,选择合适的物种材料具有重要的指导意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马婧	西北农林科技大学生命科学学院	19	153	6.0	12.0
2	孙超	西北农林科技大学生命科学学院	70	417	12.0	16.0
3	韩岗	西北农林科技大学生命科学学院	2	14	2.0	2.0
4	陶士珩	西北农林科技大学生命科学学院	9	72	3.0	8.0
5	杨健	西北农林科技大学农学院	12	135	7.0	11.0