基于Cox半参数模型检测生存性状的印记数量性状位点

• 作者: 周晓晶 方铭
• 来源期刊: 黑龙江八一农垦大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生存性状 Cox半参数模型 印记数量性状位点 区问定位
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 页码范围: 80-84
• 页数: 5页
• 分类号: Q348
• 字数: 3220字
• 语种: 中文

摘要

在生存分析中，Cox比例风险模型和加速失效模型是研究控制数量性状位点（QTL）的生存时间的常用的方法。本文首先借助于Cox比例风险模型给出了半参数的区间定位方法去表征生存性状的印记数量性状位点（iQTL）。此方法的明显优势是无需估计复杂的“讨厌”的基线风险函数。然后构造偏似然函数并根据其推断出iQTL的参数估计。采用期望最大化算法求解iQTL位置和遗传效应的极大似然估计值。所给统计推断方法保证了整个基因组范围内的显著iQTL的估计和检验，在一系列的零假设下，给出了所检测到的iQTL的印记模式。最后，此方法应用于分析一个公开发表的小鼠模型系统数据集。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周晓晶	黑龙江八一农垦大学理学院数学系	52	116	7.0	8.0
2	方铭	黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院	10	14	2.0	3.0