基于SSU rDNA和线粒体cox1序列分析甲藻中不同生态类群的演化规律

• 作者: 于克锋 何培民 吴维宁 唐晨 徐韧 王金辉 董丽 贾睿 饶涛
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 浮游型甲藻 底柄型甲藻 利玛原甲藻 强壮前沟藻 SSU rDNA cox1
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 页码范围: 577-585
• 分类号: S96
• 字数: 5395字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2012.00577

摘要

应用SSU rDNA和线粒体cox1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系.通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodiumfalciparum为外群,构建ML树和NJ树,并采用自展支持度评估进化树分支结构,通过计算后验概率评估进化树整体结构,应用1sKH、SH、ELW和2sKH等方法评估两株ML树间的拓扑结构.结果显示,在由上述两序列构建的进化树上,底栖原甲藻均未与浮游原甲藻聚类,且前沟藻具有独特演化地位.表明联合选择SSU rDNA和线粒体c甜1序列构建的进化树在一定程度上能够反映出甲藻的演化规律.这为从基因层面深入探索甲藻中不同生态类群的演化关系初步奠定了基础.