松江鲈鱼野生群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化

• 作者: 刘至治 唐文乔 曾珍 潘连德 王茜 耿云皓
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 松江鲈鱼 遗传多样性 RAPD SCAR标记
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 203-210
• 分类号: Q959.483|Q343
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2012.02203

摘要

首先,从294条10个碱基随机引物中,筛选出32条多态性引物,对富春江、黄河、滦河和鸭绿江等4个松江鲈鱼(Trachidermus fasciatus)野生群体共120尾个体进行RAPD分析.结果表明,松江鲈鱼野生群体的遗传多样性较丰富,其主要表现在:①在扩增得到的591个位点中,有515个(87.14％)位点呈现多态性,群体间多态位点比率(P)的大小顺序为:富春江群体89.17％＞黄河群体87.99％＞鸭绿江群体86.63％＞滦河群体83.25％.②松江鲈鱼群体间的Shannon信息指数(IT)和Nei's遗传多样性指数(HT)分别在0.3393～0.3566和0.2157～0.2279间,滦河群体的值较其他3群体稍低；若作为一个整体,则总的Shannon信息指数(IT)和Nei's遗传多样性指数(HT)分别为0.3710±0.2153和0.2336±0.1643.③虽然群体间基因流值(Nm)在5.76103～19.84497间,显示各地理群体间存在程度不同的基因交流,但分子方差分析(AMOVA)结果却表明,各群体间存在显著(P＜0.05)或极显著(P＜0.01)的遗传分化.④聚类分析表明,鸭绿江群体首先与黄河群体聚为一支,再与富春江群体相聚,最后与单独一支的滦河群体聚类,表明鸭绿江、黄河、富春江等3群体间的遗传距离与彼此间的地理距离远近密切相关,而滦河群体与它们的遗传距离较远.其次,从获得的S1225525 bp、S1225605 bp、S1225841 bp、S1345695bp、S1345825 bp等5个特异RAPD条带中,成功地由S1225605 bp、S1225841 bp条带分别转化出SCAR0 1560 bp、SCAR02443 bp的SCAR标记.这两个标记的出现频率,在鸭绿江群体最高(96.67％和93.33％)、富春江群体其次(83.33％和90％)、黄河群体再其次(56.67％和66.67％)、滦河群体最低(13.33％和20％).因此,SCAR01560 bp、SCAR02443 bp可作为鉴别松江鲈鱼滦河群体与其他3群体的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘连德	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	61	275	8.0	12.0
2	唐文乔	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	65	364	10.0	16.0
3	刘至治	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
4	王茜	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	8	31	2.0	5.0
5	曾珍	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	17	1.0	2.0