猪SLA-DQA基因外显子4多态性分析

• 作者: 刘丽霞 姜天团 孔晶晶 封洋 李峰松 杨巧丽 滚双宝 王国旺 赵生国
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: DQA基因 多态性 PCR-SSCP 等位基因
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 页码范围: 86-90
• 分类号: S828
• 字数: 3880字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.03.017

摘要

采用PCR-SSCP及克隆测序技术对大白、长白、杜洛克共210头仔猪SLA-DQA基因第4外显子进行多态性检测,以探讨猪SLA-DQA基因的遗传特性.结果显示:共获得4种等位基因(A、B、C、D),6种基因型(AA、AB、CC、CD、BB、BC).6种基因型在杜洛克猪中都被检测到,而在大白猪中只检测到AA、AB、CC 3种基因型,在长白猪中未检测到BC基因型.A等位基因和AA基因型的频率在3个群体中最高,为优势基因和优势基因型.对不同SSCP带型的对应片段进行测序分析,共发现3个核苷酸突变位点(5126bp A→G,5158bp A→T,5233bp G→A),其中,5126bp处A→G导致氨基酸由异亮氨酸变为缬氨酸.经x2适合性检验,3个猪品种在此位点上都偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05).群体遗传学分析发现:长白猪、大白猪多态信息含量(PIC)分别为0.3233,0.4548,属于中度多态(0.25＜PIC＜0.5),杜洛克为0.6101,属于高度多态(PIC＞0.5)；各基因型在三品种中的分布差异显著.研究结果证实,猪SLA-DQA基因第4外显子具有丰富的遗传多态性.